Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1P70338 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms