Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbx6P70327 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms