Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cux2P70298 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cux2P70298 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cux2P70298 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cux2P70298 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cux2P70298 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cux2P70298 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cux2P70298 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms