Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif1P70284 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms