Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stra8P70278 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stra8P70278 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms