Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd13P70217 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms