Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig1P70193 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms