Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kcnab1P63143 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms