Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crabp1P62965 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crabp1P62965 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crabp1P62965 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crabp1P62965 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms