Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rab1AP62821 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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