Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acta2P62737 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Acta2P62737 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Acta2P62737 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Acta2P62737 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Acta2P62737 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Acta2P62737 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms