Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl18aP62717 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms