Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snrpd1P62315 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms