Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps13P62301 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms