Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms