Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab10P61027 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab10P61027 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms