Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sem1P60897 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sem1P60897 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms