Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ppfia3P60469 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ppfia3P60469 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms