Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rin3P59729 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms