Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp4P59240 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp4P59240 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms