Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Senp1P59110 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms