Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrnp3P59055 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrnp3P59055 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms