Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hrh3P58406 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms