Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpf3P58269 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpf3P58269 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms