Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms