Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd5P56812 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms