Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd38P56528 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms