Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gp1bbP56400 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms