Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8aP55258 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8aP55258 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms