Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1P55194 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp1P55194 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms