Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ephb3P54754 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ephb3P54754 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms