Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbtP53395 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DbtP53395 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DbtP53395 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DbtP53395 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbtP53395 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DbtP53395 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DbtP53395 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DbtP53395 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms