Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2e1P52482 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2e1P52482 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms