Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PkmP52480 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PkmP52480 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PkmP52480 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PkmP52480 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PkmP52480 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms