Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp10P52479 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp10P52479 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp10P52479 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms