Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnfP51944 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnfP51944 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms