Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Opn1swP51491 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms