Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RoraP51448 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RoraP51448 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RoraP51448 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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