Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FmodP50608 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FmodP50608 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FmodP50608 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FmodP50608 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FmodP50608 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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