Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms