Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb42P49222 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epb42P49222 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms