Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ptx3P48759 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms