Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prox1P48437 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms