Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms