Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx2P48031 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms