Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl13P47963 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms