Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CratP47934 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CratP47934 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CratP47934 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CratP47934 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CratP47934 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms