Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl6P47911 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms