Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg3P47867 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg3P47867 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg3P47867 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms