Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax9P47242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax9P47242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax9P47242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax9P47242 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax9P47242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax9P47242 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax9P47242 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms